Peter Parker, Queens'te yaşayan bir bilim dehasıdır. Genetik yapısı değiştirilmiş bir örümceğin ısırığı ile çeşitli güçlere sahip olur. Bir hırsızı durdurabileceği halde durdurmaz ve o hırsız Peter'ın amcası Benjamin'i öldürür. Amcasının ölümünden suçluluk duyar kendisi için dikilen özel kostümü giyerek suçla savaşmaya başlar. Bu kostüm Spider-Man'in her zamanki görev kostümüdür.

Uzun zaman önce, uzak bir ülkede ben Aku karanlığın şekil değiştiren efendisi, serbest bırakılmış korkunç bir şeytandım. Ama, sihirli bir kılıç kullanan, ahmak bir samuray savaşçısı önüme çıkıp bana karşı koymaya çalıştı. Son darbe vurulmadan önce, zamanda bir kapı açtım. Ve onu kötü ruhumun hakim olduğu geleceğe yolladım. Ve şimdi o ahmak geçmişe dönmenin ve geleceğin kendi olan Aku'yu mahvetmenin yollarını arıyor.

Dizide, dört Kaplumbağa'nın kişiliği Mirage Comics karakterlerinin daha yakından takip girişimindeki 1987'deki diziden bazı yollarında farklıdır. Tüm karakterlerin çoğu karmaşık bireylerdir, ve Kaplumbağalar güçlü bir aile bağına sahiptir. Sesi de eylem üzerine vurguyla biraz daha ciddidir. Şovun neredeyse kaba komedi ya da önceki animasyonundaki gibi ağır kelime oyunlarına kadar özelliği yoktur. Seri kapakları Kaplumbağalar'ın lağımlardan çıkıp, uzaya, alternatif boyutlara, geleceğe ve en sonunda eve birkez daha eve gelme maceralarının geniş bir kapsamıdır. İlk birkaç sezon Kaplumbağalar'ın Shredder ve Foot'a karşı savaşmalarını konu alır, sonraki sezonlar başka rakiplerin dahil olmasında gelişir.

1999 Yapımı Spider-Man Unlimited animasyon dizisidir.